导致木制托盘发霉的原因有很多种，由于木材内含有多种微生物，而木纤维中含有大量的养料，可以供微生物进行繁殖、生长，比如蛋白质、纤维素、淀粉等等，那么在夏季使用的话，高温为微生物提供了更好的繁殖环境，因此木制托盘就会出现发霉现象。而寒冷的冬季，无法为微生物提供繁殖环境，所以冬天木制托盘很少会出现发霉的现象。
木托盘作为现代物流行业中的一种搬运工具，在货物搬运中发挥着重要的作用，不仅能够确保货物在搬运过程中的安全，还能有效提高工作效率，完全不受工作环境的影响，在任何环境中，都能很好的发挥出口木托盘的作用。出口木托盘本身具有良好的牢固性，在使用性能方面能够为物流行业带来很大的便利条件，因此更多的物流公司愿意使用出口木托盘作为货物搬运工具。由于出口木托盘在使用过程中，需要搬运各种货物，难免会在出口木托盘表面残留污渍，久而久之，就会为出口木托盘带来一定的影响，因此需要及时将污渍处理干净。
木托盘发货时需注意事项：
1、物料管理科接到“订货通知单”时，经办人员应依木托盘规格及订货通知单编号顺序列档，内容不明确应即时反映业务部门确认。
2、因客户业务需要，收货人非订购客户或收货地点非其营业所在地的，根据情况办理交运。
3、订制品交运前，物料管理科如接到业务部门的暂缓出货通知时，应立即暂缓交运，等收到业务部门的出货通知后再交运。紧急时可由业务部门主管先以电话通知物料管理科主管，但事后仍应立即补办手续。
4、订制品(计划品)在客户需要日期前缴库或“订货通知单”注明“不得提前交运”的，物料管理科若因库位问题需提前交运时，应先联络业务人员转知客户同意，且收到业务部门的出货通知后始得提前交运，若系紧急出货时，应由业务部主管通知物料管理科主管先予交运，再补办出货通知手续。
5、物料管理科接获“订制(货)通知单”才能发货，但有指定交运日期的，依其指定日期交运。
出口木托盘发霉主要的处理方式：
1、烘干：此方法可以解决大部分问题，但是成本价格昂贵，并且容易导致木材出现裂纹，但特殊的用途比如密封包装，仓库湿度大，出口时在海上湿热环境等等情况下就不管用了。空气干燥(自然晾干)成本低，但是耗时长。
2、熏蒸：此方法主要是针对出口的木质包装进行杀虫，而且有效期比较短。很多误以为是防霉，其实它对霉菌的防治一点效果都没有的。
3、热处理：要有专门的设备，而且处理成本高，可以降低木材中水份含量，但不能解决根本问题。
4、防腐：此方法主要是针对室外应用的景观木或者家具木处理，常用的药水为ACQ和CCA等,采用真空高压的方式把药水打到木材里边，一般渗透比较厚，主要是防虫杀细菌等等，但其对霉菌效果不怎么好，往往看到景观木发霉的到处都是。
5、防霉：使用专业的木材防霉剂对其处理,可以采用快速浸泡或者喷刷等方式处理，但是防霉剂的成本价格很高，并且对操作人员以及工作环境容易造成伤害和污染。
6、防潮剂：现在国际上通用放置集装箱干燥剂(货柜干燥剂)来防止受潮，为防止潮气渗入，可以用吸湿最强的氯化钙干燥剂，放在集装箱内，其次装箱前检查集装箱是否用水冲洗过，采取了干燥处理没有。