有机养殖业中的动物福利是指尊重动物自然生长规律，充分考虑动物生理、环境、卫生、行为及心理需求。
生理方面
(1)提倡自然繁殖，禁用胚胎移植、克隆等人工繁殖技术;
(2)禁止进行非治疗性手术，如断尾(羔羊除外)、断喙、断趾、烙翅、仔猪断牙及其他标准中没有明确允许采取的非治疗性手术。[2]
环境卫生及行为方面
生产有机畜禽产品的养殖场，应保证饲养的畜禽数量不超过其养殖区域的载畜(禽)量。此外，
(1)禁止采取使畜禽无法接触土地的笼养等饲养方式和完全圈养、舍饲、拴养等限制畜禽自然行为的饲养方式。
(2)畜禽的饲养环境(圈舍、围栏等)必须满足下列条件，以适应畜禽的生理的行为需要:
①保留足够的活动空间和时间。畜禽运动场地应有遮蔽;
②保持空气流通，自然光照充足，但应避免过度的太阳照射;
③保持适当的温度和湿度，避免受风、雨、雪等侵袭;
④提供足够的垫料;
⑤提供足够的饮水和饲料;
⑥不使用对人或畜禽健康明显 有害的建筑材料和设备;
⑦避免畜禽遭受野生捕食动物的伤害;
⑧群居性畜禽涌单栏饲养，特殊情况例外;
⑨确保所有畜禽能在适当的季节都可以到户外活动。[2]
心理方面
养殖过程中尽量避免动物应激情况的发生，以减少动物 恐惧和焦虑的心情。