黑豚鼠拥有黑色的耳朵、黑色的眼睛、黑色的脚趾、油光发亮的黑色毛皮，它身形短粗、头圆大、颈短、无尾、耳朵和四肢短小、眼睛明亮，耳壳薄而血管鲜红明显，上唇分裂。门齿呈弓形深入颌部，咀嚼面锐利， 能终身生长。当咬合不正时，门齿臼齿会过度生长。黑豚鼠嚼肌发达。前肢有四趾，后肢有三趾，每趾都有突起的大趾甲，趾上的爪短而锐利，不抓人，不善攀登和跳跃。脚形似豚，体长225～355mm。被毛紧贴体表。
黑豚鼠喜欢安静、干燥、清洁的环境。对外界环境的变化非常敏感，遇有异常响声、震动或环境变化，或竖耳静听，惊慌失措，或乱蹦乱跳，发出很响的逃足声以”通知”它的伙伴：受惊吓的妊娠母黑豚鼠最容易流产；正在分娩的母黑豚鼠受惊吓会难产；有的会咬死初生豚仔；哺乳母豚受惊吓拒绝给豚仔吃奶；正在采食的黑豚鼠 ，受惊吓往往停止采食。对经常性搬运和扰动很不习惯，搬运、重新安置或触摸可使黑豚鼠体重在24～48小时内明显下降，情况稳定后又很快恢复。因此，保持黑豚鼠圈舍的环境安静，是养好黑豚鼠工作中最重视的问题之一。为了保持环境安静，豚舍不要与机器建立在一起，平时在舍内操作动作要轻，不要大声喧哗，不要让人群围观，不要让狗、猫等动物进入黑豚鼠场内。
黑豚鼠性情非常温顺。母兔产仔或带仔时， 出于它的母性行为，捕捉时有时会主动伤人。而黑豚鼠既不会咬人，也不会抓人。它惟一的反抗就是”逃跑”。人捕捉时只发出小的叫声，抓上手后，不再发出叫声。黑豚鼠的耳朵及四肢短小，不善跳跃，也不能攀登，只要舍池、舍圈、笼舍高上40厘米，它就乖乖躲在里面。在安静的情况下，突然的响声、人与其他动物的闯人都会引起黑它的骚动和惊恐。由于它的性情温顺，许多人将它当宠物饲养。
在自然光照条件下，黑豚鼠日夜采食，两餐之间有较长的休息期。饥饿时听到饲养人员的声音特别是拿饲料的声音时会发出“吱吱”的叫声，常整群一齐尖叫。黑豚鼠愉快时能发出“啾啾”类似鸟鸣的声音。黑豚鼠属于饮食不洁的动物，如果使用的食具不得当，黑豚鼠常在食物上边吃边排便或把食物扒散、将饮水喷出。