1.自我评价。企业对照《认定办法》第十一条和《工作指引》第三部分进行自我评价。自评符合条件的，可按照《认定办法》和《工作指引》有关规定和本通知要求准备申报材料。
2.注册填报。申报企业登录管理工作网”在企业申报入口进行注册登记，待注册机构确认后进行申报书的网上在线填报。已注册企业无需重新注册，可用原用户名和密码登录系统进行申报。
3.网上提交。企业在管理工作网”，按系统要求填写认定申报信息、逐一上传附件材料（附件材料须清晰、可辨），并及时通过网络提交到省认定机构，完成网上填报。
4.纸质材料提交。企业通过管理工作网”生成并打印，并提供相关附件材料。附件材料须与申请书所填内容对应，并本着“与认定条件紧密相关”的原则，尽量精洁、扼要，跟认定条件无关的附件材料如科技人员的等一律无需提报，申报材料内容及要求见附件2。按照属地原则，高新区外企业将纸质材料提交所在市科技局高新区（含黄三角农高区）内企业将纸质材料提交所在高新区科技，企业还须妥善留存一份纸质申报材料备查。对涉密企业，应按有关保密工作规定，将申报材料做脱密处理，确保涉密信息。
5.材料审核。科技收到企业申报材料后，要通过现场考察、调阅相关资料等方式对申报材料中知识产权、近三年项目研发活动和成果转化情况、2018年度的科技活动人员和高新技术产品（服务）情况、研发组织管理水平等内容的真实性、合规性行认真审核把关，客观记录核查中发现的问题，填写好《申报核实意见表》（附件3，装订在申报材料页）。现场核实情况与申报材料不一致的企业，不得推荐上报。同时，加强与当地安监、环保、质监等的信息沟通，对企业申请认定前一年内是否发生、质量事故或严重环境违法行为进行审核把关。
6.汇总推荐。各市科技局、各高新区须正式行文出推荐函，推荐函、推荐汇总表（各一式四份）以及企业认定申请材料（一份）按受理时间节点统一报省认定办，同时将企业上报的认定申请纸质材料存档一份备查；推荐函及推荐汇总表连同各企业认定申请材料同时抄送同级财政