好氧堆肥是在有氧的条件下，借助好氧微生物（主要是好氧）的作用来进行的。在堆肥过程中，有机废物中的可溶性有机物质透过微生物的细胞壁和细胞膜被微生物所吸收；固体的和胶体的有机物先附着在微生物体外，然后在微生物所分泌的胞外酶的作用下分解为可溶性物质，再渗入细胞内部，微生物通过自身的生命活动—氧化还原和生物合成过程。把一部分被吸收的有机物氧化成简单的无机物，并释放出微生物生长、活动所需要的能量，把另一部分被吸收的有机物转化合成新的细胞物质。使微生物生长繁殖。产生更多的生物体，也就是说好氧堆肥是在通空气的条件下。好氧微生物分解大分子有机固体废物为小分子有机物。
滚筒式反应器进行好氧堆肥的工作原理是：由进料装置将进行了一定处理后的物料输送到进料端，传动装置驱动反应器筒体滚动，带动安装在筒体内壁的推进抄板沿着圆周运动，从而不断的将进料端的物料沿着筒体轴线方向向出料端移动，同时筒体内壁上起混合作用的抄板在简体的带动下进行圆周运动，使物料进行充分混合，而在整个过程中，物料便进行着好氧发酵分解。物料到达出料端后，由出料装置将物料输送到指定地点。此时，滚筒式好氧发酵反应器便对物料完成了一次好氧发酵堆肥，物料在输送到的指定地点进行后续的堆肥。滚筒式反应器筒体及内部结构材料采用Q235，传动装置采用组合式大速比减速机，具有传动平稳，抗冲击，噪音低等特点。反应器能耗低，保温层使堆肥释放的热量用于物料升温，可大幅降低能耗。处理能力强，设备日处理量为1-20吨，也可定制更大规格产品，或多台产品组合生产，应该范围广，可处理的物料有：动物粪便，餐厨垃圾，农业废弃物，园林垃圾，污泥等有机废物。