对申请人的作用：有助于其顺利参与各类经济活动。在许多交易中，对方可能要求提供担保以降低风险，申请人通过提供保函，可以满足对方的要求，增强自身在交易中的信用度，从而更容易获得合同、订单等商业机会。

与抵押、质押的区别：抵押和质押是物的担保，需要以特定的财产作为担保物；而保函是一种信用担保，不需要提供具体的实物资产作为担保，而是凭借担保人的信用来承担担保责任。在实现担保权益的方式上，抵押和质押需要通过对担保物进行处置来实现债权，而保函则是由担保人直接向受益人支付款项来履行担保义务。

项目进度调整：若项目提前或推迟完成，预付款的返还或抵扣时间也会相应变化，此时可协商调整保函期限。如项目提前完工，预付款提前抵扣完毕，可协商提前终止保函期限。

从风险保障角度看

预付款保函的核心作用是保障预付款的，确保在申请人未能按照合同约定使用预付款或履行相应义务时，受益人能够得到补偿。即使预付款已经使用完毕，但在项目执行过程中可能还存在其他与预付款相关的潜在风险，如因申请人原因导致项目中途停滞、质量不达标等情况，可能需要用预付款进行弥补或扣除相应款项，所以保函期限超过预付款使用期限能为受益人提供更的风险保障。