台湾泥鳅是无胃鱼，饵料在肠道中的消化时间很短，排空速度特别快，其肠道通常是前半段用来消化食物，后半段用来呼吸 。投喂不当就会产生胀气，消化不良，引起肠炎。在投喂时重要注意以下几个方面：
1、台湾泥鳅投苗后开始适量投饵，饲料以蛋白质含量在36%～38%的膨化饲料为好。目前市场上使用台鳅料主要是膨化料。膨化料由于其独特的加工工艺，具有水中稳定性好，消化吸收率高等优点。此外，由于泥鳅是营底栖生活，膨化料散失少，可以减少对泥鳅生活环境的污染，利于泥鳅健康生长。因此台湾泥鳅养殖应投喂粒径适合鳅苗口径的膨化料，既可满泥鳅长时间摄食，减少浪费，也更加有利于泥鳅健康生长。
2.台湾泥鳅具有贪食的特点，因此在养殖过程中应特别注意投喂量，尽量避免过量投喂。投料量通过摄食时间进行观察，一般以喂七成饱为最佳，投喂料尽量能在1小时内摄食完成，低于30分钟内吃完说明投喂量不足，超过2小时还没吃完，说明投喂量超标。由于泥鳅肠道兼具消化吸收及呼吸作用，严格控制投喂量，能更好的保证泥鳅健康生长，避免疾病发生。
3、台湾泥鳅属于淡水鱼鱼类，其摄食跟受水温影响，当水温低于12度时，泥鳅不摄食，不必投喂。低于18度时每天适当投喂一次，18度以上可以每天适量投喂两次。台湾泥鳅最适宜的生长水温在22度～30度，当水温在25度～28度时，食欲旺盛，捕食强烈，生长迅速，可多投喂。超过30度时，可以不头尾，或者适当减量投喂。但投喂时还应水质、天气、水温、摄食情况灵活掌握，以既让鱼吃饱，又不剩残饵为度，达到即可节省饲料、又不败坏水质，保持良好水域环境的目的。