一、赤皮病
此病由于捕捞、运输过程中碰伤鳅体，或因水质恶化而引起细菌侵入，诱发此病。病鳅的鳍、腹部皮肤及肛门周围充血、溃烂，尾鳍、胸鳍发白溃烂尤为明显，危害较严重。
防治方法
发现此病可按1立方米水体溶解20克呋喃奈斯水溶液，浸洗病鳅15分钟～20分钟；也可用占全池鳅鱼体重0.04%的呋喃奈斯拌饵投喂，连喂3天，疗效比较显著。
二、曲骨病
病鳅背骨弯曲，因孵化时水温异常及缺乏维生素所致。
防治方法
孵化时保持适温，防止水温急剧变化，投喂混合饲料。
三、水霉病
由于水温较低或冬季鳅体受伤，开春后易感染水霉病。病鳅身上长满白色棉絮状的水霉。
防治方法
发现此病，用2%～5%的食盐水浸洗病鳅5分钟～10分钟，也可用浓度为10毫克／升的福尔马林溶液浸洗15分钟～30分钟，即可治愈水霉病。
四、寄生虫病
泥鳅种苗阶段常见有车轮虫、三代虫等寄生虫，被寄生虫侵袭的鳅苗常常浮于水面，急促不安，或在水面打转。
防治方法
发病鱼池可按1立方米水体用0.5克硫酸铜和0.2克硫酸亚铁制成的合剂全池泼洒。
五、气泡病
鳅苗阶段，由于水中氧气或其他气体含量过多，易导致气泡病。病鳅肠中充气，腹部鼓起，浮于水面。
防治方法
发病重池，可用浓度为1克／升的食盐水全池泼洒，或加入新鲜水体。平时投饵要注意适量、多样化，并加强水质管理，可以预防此病的发生。
六、敌害生物
泥鳅的主要敌害生物有蛙类、水生昆虫、鸟类及凶猛肉食性鱼类。
防治方法
1.清除池边杂草，保持养殖环境卫生，严防蛙类侵入，发现蛙类应及时捕捉，蛙卵要及时捞除；2.进水口要用筛绢网拦好，防止野杂鱼随进水时进入池中；3.发现鸟类，及时驱赶。