土鸡的疾病按其发生原因不同，一般可分为传染病寄生虫和普通病三大类传染病是由―定的病原微生物（细菌病毒等）侵入鸡体内生长繁殖，破坏鸡的机体正常生理功能 并能在鸡群中广泛传播，引起其他易感鸡发生相同疾病的一类疾病，如鸡新城疫、禽霍乱等。寄生虫病是由某种寄生虫侵袭鸡体后引起的疾病，也能在鸡群中传播、蔓延，使其他健康鸡发病，如球虫病、住白虫病等。
普通病是由各种刺激物的作用以及饲料中某些营养素的缺乏或含有某种有毒物质而引起的疾病。普通病不会传染，但在集中饲养的情况下，可能会造成鸡大批发病，如维生素缺乏症、食盐中毒、黄曲霉毒素中毒、喹乙醇中毒等