在无菌实验室的安装以及设计中，应该注重的问题就是对实验室的整体规划，同时要考虑的问题也比较多，比如建筑行业，以及在实验室中的水电和空调，要让使用实验室的技术人员进行共同参与讨论和计划，这样做的目的就是为了创造一个能够确保实验室以及稳定比较有保障的执行，同时也能满足大家的使用以及有保障的工作场所，同时也正是因为无菌实验室是拿来当做无菌操作的一个房间，所以在装饰以及消毒上的条件是比较严格的。
在无菌实验室的改造中，应该知道的一点那就是在无菌室里面，应该完全的封闭，大家都知道，在我们生活中细菌可以说随地可见，但是我们想打造一个无菌的实验室就要非常注意这些问题，如果不注意就会变成“有菌”实验室，所以在门的设计上，是要封闭的才对，其次就是人员出入应该使用两道门，同时应该有缓冲区才行。
在装修改造之后，应该注意的问题就是使用之前应该用紫外线来对整个房间进行消毒，因为要打造一个无菌实验室，在这一方面还是要非常注意的，其次就是要定期使用乳酸以及甲醛熏蒸来对房间进行一个处理，这样就可以保持一个比较好的无菌实验室。