我国航空托运货运以纺织制品、玩具、工业制成品等传统工业制品为主，国外航空公司运输的多以高附加值、运输价格承受力强的快件、电子电器、生物医药等为主。目前我国航空托运80%～90%的航空快件被跨国快递公司和航空公司垄断，由此导致境外航空公司国际航线收入远高于我国民航公司。货源以普通货为主，高附加值和快件等产品比重偏小。
1.载运能力低，飞机的机舱容积有限，造成航空物流运输的载运能力较低，对大件货物或大批量货物的运输有一定的限制。
2.受气候条件限制较大，航空物流运输对气候条件要求很高，飞机飞行容易受恶劣气候影响，从而影响运输的准点性与正常性。
3.运费高，因飞机的机舱容积和载重能力较小，因此，单位运输量的能耗较大，另外，飞机的机械维护及保养成本也很高，这些因素导致航空货运的单位运输成本很高。
4.可达性差，在通常情况下，航空物流运输都难以实现客货的“门到门”运输，必须借助其他运输工具转运。