履约保函和保证金的区别在于履约保函在办理的时候手续非常的繁琐，但是在保函当中会有一个明确的有效期，在到了这天之后，乙方的钱就会自动从银行获得自由，而不需要甲方同意或者是不同意。

而办理履约保证金的话，那么总体的手续就比较简单了，只需要直接交钱给买方或者是是交易中心，就能够对于我们的合同进行现金的保障，但是履约保证金只能够保证合同的正常进行，到了约定时间之后，我们的本金并不是能够马上就收回来的。

因此，双方选择履约保函是一个比较明智的选择。