首先，我们来深入探讨一般纳税人和小规模纳税人在进项抵扣方面的不同。对于一般纳税人而言，进项发票的获取与抵扣是其日常税务管理的重要环节。通过合法的进项抵扣，企业可以有效降低应纳税额，从而减轻税务负担。这种抵扣机制鼓励企业规范财务管理，确保每一笔交易都有合法的凭证作为支撑。而小规模纳税人则无法享受这一权益，其应纳税额通常直接按照销售额与征收率的乘积计算，无需考虑进项抵扣的问题。

然而，无论是一般纳税人还是小规模纳税人，都面临着进项发票缺失的风险。当企业出现进项发票缺失时，一般纳税人所受影响尤为严重。因为进项发票是增值税抵扣的重要依据，缺失发票意味着无法享受相应的抵扣权益，从而导致应纳税额的增加。对于小规模纳税人而言，虽然其应纳税额不受进项抵扣影响，但缺失发票也可能引发税务部门的关注，增加税务风险。

面对这一问题，企业应当采取积极的应对措施。首先，加强内部管理，确保每一笔交易都有合法的凭证作为支撑。对于一般纳税人而言，建立完善的发票管理制度尤为重要，包括发票的开具、收集、保管和抵扣等环节。同时，企业还应当加强员工培训，提高员工对税务法规的认知和遵守意识。

其次，企业可以寻求专业的税务咨询和代理服务。专业的税务顾问能够为企业量身定制税务策略，帮助企业合法合规地降低税负。同时，税务代理服务还可以为企业提供日常的税务申报、发票管理等服务，减轻企业的税务负担。

此外，对于一般纳税人而言，合理利用税收优惠政策也是降低税负的有效途径。国家为了鼓励企业发展，制定了一系列税收优惠政策，如高新技术企业税收优惠、研发费用加计扣除等。企业应当充分了解并合理利用这些政策，以减轻税务负担。

对于小规模纳税人而言，虽然无法享受进项抵扣的权益，但也可以通过规范财务管理、提高经营效率等方式降低税负。此外，小规模纳税人还可以关注税务政策的变动，以便在符合条件的情况下及时申请转为一般纳税人，享受更多的税务权益。