云南省核工业二九地质大队组建于1966年12月,原队名:中南二九大队 。1971年至1981年月12月由二机部三局领导,作为局直属队,隶属于二机部三局;1981年2月队名改称第二机械工业部三局二九地质大队;1984年1月至1999年12月隶属核工业西南地质局领导,队名于1984年6月改称核工业部西南地质勘探局二九大队。1988年10月20日,中国核工业总公司将核工业部西南地勘局二九大队更名为核工业西南地质勘探局二九大队,2000年1月至今为云南省核工业二九地质大队。1999年属地化管理后,隶属于云南省国防科工办,是享受全额财政拨款的正处级事业单位,下划全额财政拨款人员1067人,其中在职人员484人。截止2010年6月全队共有职工998人,其中离退休698人,在职300人。其中,专业技术人员156人,中级职称以上132人,是一只从事地质勘查及矿业开发的专业地勘队伍,同时是核工业西南地区从事铀矿地质勘查及矿业开发的骨干专业队伍,负责云南全省的铀矿地质普查勘探工作。
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